Шиничи Кудо ученик старшей школы, который обожает разгадывать разные тайны и загадки, так он становится японским Шерлоком Холмсом. Однажды, когда он гулял со своей подругой, на них напали члены мафиозной группировки и заставили главного героя выпить странную пилюлю. Действие пилюли сработало таким образом, что Шаничи Кудо превращается в семилетнего ребенка. Теперь главный герой, его подруга по имени Ран и ее отец – детектив начинают распутывать эту загадочную историю, чтобы понять кому и с какой целью понадобилось вытворять такое.